W sezonie 2009 po raz pierwszy certyfikaty ZŁOTY BIEG, specjalne wyróżnienia oraz FILIPIDESY 2009 zostaną przyznane w całkowicie nowej formule - bezpośrednim głosowaniu czytelników. Proces przyznawania certyfikatów został podzielony na dwa etapy. W pierwszym etapie członkowie redakcji portalu MaratonyPolskie.PL biorąc pod wagę oceny wystawione przez czytelników w RANKINGU BIEGÓW nominują wybrane biegi do poszczególnych klasyfikacji certyfikatów. Lista nominowanych biegów opublikowana w dniu 26.10.2009, następnie może ona ulec poszerzeniu do dnia 1 listopada 2009 na podstawie uargumentowanych wniosków organizatorów biegów przesłanych na adres redakcji poczta@maratonypolskie.pl

W dniach 1-8 listopada bezpośrednio na łamach portalu MaratonyPolskie.PL odbędzie się głosowanie nad wszystkimi nominowanymi imprezami, podczas których każdy z czytelników ma prawo oddać swoje głosy na kilka wybranych imprez zarówno w kategorii głównej ZŁOTE BIEGI 2009, jak i wszystkich klasyfikacjach dodatkowych - FILIPIDESACH 2009. Wszystkie imprezy rywalizujące o tytuł ZŁOTY BIEG 2009, a które go nie otrzymają automatycznie zostaną przekwalifikowane do kategorii Wyróżnień. Natomiat trzy biegi z grupy WYRÓŻNIONYCH zostaną odznaczone jako ZŁOTE BIEGI 2009

Wyniki głosowania zostaną opublikowanie w dniu 9 listopada 2009, a wszystkie certyfikaty zostaną uroczyście wręczone podczas KONFERENCJI POLSKIEGO STOWARZYSZENIA BIEGÓW, która będzie miała miejsce w dniach 20-22 listopada 2009 w Jarosławcu. Liczba uhonorowanych biegów w ramach poszczególnych kategorii zostanie ustalona przez redakcję portalu MaratonyPolskie.PL. FILIPIDESY 2009 w kategoriach Mecenas Biegów oraz Honorowy Organizator zostaną przyznane przez kolegium redakcyjne portalu.